Investigation of the Biological Role of Mouse Acylneuraminyl Hydrolase Enzymes in the Regulation of Neuroinflammation

dc.contributor.advisor Seyrantepe, Volkan
dc.contributor.author Tabakacılar, Doğa
dc.contributor.other 04.03. Department of Molecular Biology and Genetics
dc.contributor.other 04. Faculty of Science
dc.contributor.other 01. Izmir Institute of Technology
dc.date.accessioned 2022-09-22T09:06:24Z
dc.date.available 2022-09-22T09:06:24Z
dc.date.issued 2022-06
dc.description Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics, Izmir, 2022 en_US
dc.description Includes bibliographical references (leaves. 46-55) en_US
dc.description Text in English; Abstract: Turkish and English en_US
dc.description.abstract Sialidosis is a lysosomal storage disorder, and it is inherited by autosomal recessive mutations in the Neuraminidase 1 (NEU1) gene. Neuraminidases or sialidases are catalytic enzymes that carry out the desialylation of glycoconjugates. Deficiencies of neuraminidases lead to the accumulation of sialoglycoconjugates in membranes of cells. Neuroinflammation and neurodegeneration are present in some lysosomal storage diseases such as Tay-Sachs. However, in the sialidosis mouse model, neuroinflammation was never studied. In this study, we investigated the effect of neuraminidase 1, neuraminidase 3, and their combined deficiency on neuroinflammation by using Neu1-/-, Neu3-/- knockout, and Neu1-/- Neu3-/- double knockout mouse models. Neu1-/- Neu3-/- knockout mouse model was smaller in comparison to its littermates and showed muscle weakness, tremoring, and 2-3 weeks of a lifetime. Some of the Neu1-/- Neu3-/- mice died prematurely. To unravel the pathology immunohistochemical, biological, and chromatographic techniques were used. The expression of inflammatory cytokines was altered in the Neu1-/-, Neu3-/-, and Neu1-/- Neu3-/- mice with respect to the brain section. Neu1-/- Neu3-/- mice showed generally the highest expression of cytokines in the cerebellum compared to the cortex. Neuronal loss was observed in the Neu1-/- Neu3-/- mice in the cortex, thalamus, and cerebellum. The most remarkable change was in the ganglioside expression pattern in the Neu1-/- Neu3-/- mice cortex. GD3 expression was present in the cortex of Neu1-/- Neu3-/- mice where expression of this ganglioside is related to neuroinflammation, neurodegenerative stimuli, autophagosome remodeling and programmed cell death. en_US
dc.description.abstract Sialidoz bir lizozomal depo bozukluğudur ve kalıtımı Neuraminidase 1 (NEU1) genindeki otozomal resesif mutasyonlarla sağlanır. Nöraminidazlar veya sialidazlar, glikokonjugatların desialilasyonunu gerçekleştiren katalitik enzimlerdir. Nöraminidazların eksiklikleri, hücre zarlarında sialoglikokonjugatların birikmesine yol açar. Literatürde Tay-Sachs gibi bazı lizozomal depo hastalıklarında nöroinflamasyon ve nörodejenerasyon görüldüğüne dair çalışmalar vardır. Fakat, siyalidoz fare modelinde, nöroinflamasyon hiçbir zaman çalışılmamıştır. Bu çalışmada, Neu1-/-, Neu3-/- nakavt, ve Neu1-/- Neu3-/- çift nakavt fare modelleri kullanılarak nöraminidaz 1, nöraminidaz 3 ve bu enzimlerin kombine eksikliğinin nöroinflamasyon üzerindeki etkisini araştırılmıştır. Neu1-/- Neu3-/- knockout fare modeli, kafesteki kardeşlerine kıyasla daha küçük bir dış görünüş ve kas zayıflığı, titreme ve 2-3 haftalık bir yaşam süresi göstermiştir. Neu1-/- Neu3-/- çift nakavt farelerinden bazılarında erken ölüm gözlemlenmiştir. Bu çalışmada, patolojiyi araştırmak için immünohistokimyasal, biyolojik ve kromatografik teknikler kullanıldı. Enflamatuvar sitokinlerin ekspresyonu, Neu1-/-, Neu3-/- ve Neu1-/- Neu3-/- farelerinde beyin anatomisine göre farklılıklar göstermiştir. Neu1-/- Neu3-/- farelerinin, kortekse kıyasla genellikle beyincikte en yüksek sitokin ekspresyonunu gösterdiği gözlemlenmiştir. Ek olarak, Neu1-/- Neu3-/- farelerinde korteks, talamus ve beyincikte nöron kaybı tespit edilmiştir. En dikkat çekici değişiklik, Neu1-/- Neu3-/- fare korteksindeki gangliosid ekspresyonunda görülmüştür. Nöroinflamasyon, nörodejeneratif uyaranlar, otofagozom modellenmesi ve programlanmış hücre ölümü ile ilişkilendirilmiş GD3 gangliositinin ekspresyonu, Neu1-/- Neu3-/- farelerinin korteksinde tespit edilmiştir. en_US
dc.format.extent xi, 55 leaves
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/11147/12462
dc.identifier.uri https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=sELqxhTlFGAjsbjOuuiyCMYHxp0Emd0YC9sh5D9mf_i2-m7Krwz1pCKvDY_k95SW
dc.language.iso en en_US
dc.publisher Izmir Institute of Technology en_US
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject Neuroinflammation en_US
dc.subject Lysosomal stroge disorders en_US
dc.subject Neuraminidase en_US
dc.subject Transgenic mouse models en_US
dc.subject Sialidases en_US
dc.title Investigation of the Biological Role of Mouse Acylneuraminyl Hydrolase Enzymes in the Regulation of Neuroinflammation en_US
dc.title.alternative Fare Asilnöraminil Hidrolaz Enzimlerinin Nöroinflamasyonun Düzenlenmesindeki Biyolojik Rolünün Araştırılması en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.id 0000-0002-0684-797X
gdc.author.id 0000-0002-0684-797X en_US
gdc.author.institutional Seyrantepe, Volkan
gdc.coar.access open access
gdc.coar.type text::thesis::master thesis
gdc.description.department Thesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics en_US
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
gdc.description.scopusquality N/A
gdc.description.wosquality N/A
gdc.identifier.yoktezid 747311 en_US
relation.isAuthorOfPublication cc5dbf8a-47c5-463f-8e8c-888beaf37b02
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery cc5dbf8a-47c5-463f-8e8c-888beaf37b02
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4013-8abe-a4dfe192da5e
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4005-8abe-a4dfe193da5e
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4003-8abe-a4dfe192da5e
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 9af2b05f-28ac-4013-8abe-a4dfe192da5e

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
10473496.pdf
Size:
14.72 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Master Thesis

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
3.2 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: