Fungal Biotransformation of Novel 20(27)- Octanor Cycloastragenol and Biological Activities of the Purified Metabolites

dc.contributor.advisor Bedir, Erdal
dc.contributor.advisor Çağır, Ali
dc.contributor.author Duman, Seda
dc.contributor.other 03.01. Department of Bioengineering
dc.contributor.other 04.01. Department of Chemistry
dc.contributor.other 01.01. Units Affiliated to the Rectorate
dc.contributor.other 01. Izmir Institute of Technology
dc.contributor.other 03. Faculty of Engineering
dc.contributor.other 04. Faculty of Science
dc.date.accessioned 2019-11-04T13:44:22Z
dc.date.available 2019-11-04T13:44:22Z
dc.date.issued 2019-07
dc.description Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Biotechnology, Izmir, 2019 en_US
dc.description Full text release delayed at author's request until 2020.02.23 en_US
dc.description Includes bibliographical references (leaves: 159-163) en_US
dc.description Text in English; Abstract: Turkish and English en_US
dc.description.abstract Biotransformation is the chemical modifications performed by enzymes or living organisms. The difficulty and high cost of enzyme isolation and purification makes it more advantageous to use whole cell systems as biocatalysts. Microbial biocatalysts are particularly interesting in the modification of complex molecules such as steroids and triterpenoids, which can catalyze stereo- and regio- selective reactions that are difficult or impossible to perform with chemical reactions. Specially, ability of endophytic microorganisms to produce specific enzymes for adaptation to their environment by tolerating toxic defense metabolites, makes them interesting for biotransformation studies. Telomeres are nucleotide structures located at the end of chromatids shortening with each cell division. Telomerase is a reverse transcriptase enzyme, and it helps to replenish telomere ends that are truncated by aging and stress factors. The telomerase activators (TA) with their potentials are suggested encouraging agents for healthy aging, and they are projected to generate a huge market in the future. Cycloastragenol is the only natural product in the sector marketed as a potent telomerase activator. In this study, by using endophytic fungi, the biotransformation studies were performed on 20(27)-octanor cycloastragenol. As a result, 14 biotransformation products, were isolated by chromatographic studies, and the structures of the metabolites were established by spectral methods. Based on the literature survey, 13 compounds turned out to be new for nature. Seven metabolites were screened for telomerase activation. In these screenings, metabolites showed telomerase activation ranging from 5.43 to 12.36 fold at doses ranging from 0.1 to 30 nM compared to the control cells treated with DMSO. en_US
dc.description.abstract Biyotransformasyon, enzimler ya da canlı organizmalar kullanılarak meydana getirilen kimyasal modifikasyonlardır. Enzimlerin izolasyonu ve saflaştırılmasının zor ve yüksek maliyetli olması, bütün hücre sistemlerinin biyokatalizör olarak kullanımını daha avantajlı kılmaktadır. Mikrobiyal biyokatalistler; steroitler ve triterpenoitler gibi kompleks moleküllerin modifikasyonunda, kimyasal reaksiyonlarla gerçekleştirilmesi zor ya da mümkün olmayan stereoselektif ve regioselektif reaksiyonlar katalizleyebilmeleriyle oldukça ilgi çekicidirler. Özellikle bitkinin toksik savunma metabolitlerini tolere ederek, yaşadıkları çevreye adaptasyon için spesifik enzimler üretebilme yetenekleri endofitik mikroorganizmaları biyotransformasyon çalışmaları için ilgi çekici kılmaktadır. Telomerler, kromozomlarımızın sonunda bulunan ve hücre bölünmesiyle kısalan nükleotit yapılarıdır. Telomeraz ise, yaşa ve strese bağlı olarak kısalan telomer uçlarını onarmaya yardım eden rivers transkriptaz bir enzimdir. Telomeraz enzimi aktivatörleri (TA) barındırdıkları potansiyel ile sağlıklı yaşlanma için ümit verici ajanlar olarak gösterilmektedir ve ileride büyük bir pazar oluşturacağı öngörülmektedir. Bu çalışmada anti-aging etkilerinden dolayı son dönemde önemli hale gelmiş ve sadece Astragalus türlerinde bulunan sikloastragenol (CA) molekülünün türevlerinden biri olan 20(27)-oktanor sikloastragenol (SCG) üzerinde, Astragalus bitkisinden izole edilen endofitik funguslar kullanılarak biyotransformasyon calışmaları gerçekleştirilmiş ve elde edilen yeni metabolitlerin biyolojik aktiviteleri taranmıştır. Sonuç olarak, kromatografik çalışmalar ile 14 biyotransformasyon ürünü izole edilmiş ve metabolitlerin yapıları spektral yöntemler kullanılarak belirlenmiştir. Literatür araştırması sonucunda, 13 bileşiğin doğa için yeni olduğu anlaşılmıştır. Endofitlerin enzim sistemleri; oksidasyon (çoğunlukla hidroksilasyon), halka açılması (metil göçü ve halka genişlemesi veren) ve dehidrojenasyon reaksiyonlarını katalizlemiştir. Biyotransformasyon ürünlerinin 7’si telomeraz enziminin aktivasyonuna yönelik taranmıştır. Bu taramalarda DMSO ile muamele edilen kontrol hücrelerine kıyasla metabolitler 0.1-30 nM doz aralığında 5.43 ile 12.36 kat arasında değişen telomeraz aktivasyonu göstermişlerdir. en_US
dc.description.sponsorship TUBITAK project “114Z958”, BAP Project “2017IYTE72” and Bionorm en_US
dc.format.extent xvi, 163 leaves
dc.identifier.citation Duman, S. (2019). Fungal biotransformation of novel 20(27)- octanor cycloastragenol and biological activities of the purified metabolites. Unpublished master's thesis, İzmir Institute of Technology, İzmir, Turkey en_US
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/11147/7329
dc.language.iso en en_US
dc.publisher Izmir Institute of Technology en_US
dc.relation.tubitak info:eu-repo/grantAgreement/TUBITAK/KBAG/114Z958
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject Biotransformation en_US
dc.subject Microbial biocatalysts en_US
dc.subject Telomerase activators en_US
dc.subject Endophytic fungi en_US
dc.subject Cycloastragenol en_US
dc.title Fungal Biotransformation of Novel 20(27)- Octanor Cycloastragenol and Biological Activities of the Purified Metabolites en_US
dc.title.alternative Özgün 20(27)-oktanor Sikloastragenol'ün Fungal Biyotransformasyonu ve Saflaştırılmış Metobolitlerinin Biyolojik Aktiviteleri en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.institutional Duman, Seda
gdc.author.institutional Duman, Seda
gdc.author.institutional Bedir, Erdal
gdc.author.institutional Çağır, Ali
gdc.coar.access open access
gdc.coar.type text::thesis::master thesis
gdc.description.department Thesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Bioengineering en_US
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
gdc.description.scopusquality N/A
gdc.description.wosquality N/A
relation.isAuthorOfPublication d335aa06-3459-4c4c-907c-568af866623d
relation.isAuthorOfPublication 461a570d-2493-4349-b634-a876ced8cd22
relation.isAuthorOfPublication 95611ee0-9a5b-4ec8-90ea-22896ec18aa9
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery d335aa06-3459-4c4c-907c-568af866623d
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4015-8abe-a4dfe192da5e
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4011-8abe-a4dfe192da5e
relation.isOrgUnitOfPublication 9711dc3e-de1f-44ab-8c8a-00d8a2db8ba5
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4003-8abe-a4dfe192da5e
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4004-8abe-a4dfe192da5e
relation.isOrgUnitOfPublication 9af2b05f-28ac-4005-8abe-a4dfe193da5e
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 9af2b05f-28ac-4015-8abe-a4dfe192da5e

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
10156825.pdf
Size:
13.07 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
MasterThesis

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
No Thumbnail Available
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: