Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/11147/11093
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.advisorBedir, Erdal-
dc.contributor.advisorBüyükkileci, Ali Oğuz-
dc.contributor.authorGezer, Emreen_US
dc.date.accessioned2021-08-27T12:43:29Z-
dc.date.available2021-08-27T12:43:29Z-
dc.date.issued2020-12en_US
dc.identifier.citationGezer, E. (2020). Induction of secondary metabolism of some marine derived Streptomyces species, and isolation and identification of their bioactive secondary metabolites. Unpublished master's thesis, İzmir Institute of Technology, İzmir, Turkey-
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11147/11093-
dc.descriptionThesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Biotechnology, Izmir, 2020en_US
dc.descriptionIncludes bibliographical references (leaves: 137-146)-
dc.descriptionText in English; Abstract: Turkish and English-
dc.description.abstractSecondary metabolites are natural products with low molecular weight produced by different organisms. These metabolites have a wide variety of bioactivities because of their adaptive roles in the nature. These properties make secondary metabolites important source in drug discovery studies. Streptomyces genus, on the other hand, attracts attention due to their ability to produce many secondary metabolites for the treatment of various diseases, especially infectious diseases and cancer. However, secondary metabolism is not fully expressed under standard laboratory conditions as in nature. This phenomenon limits the discovery of new/novel bioactive molecules from the microbial sources. In this study, a previously studied marine derived actinobacterium, namely Streptomyces cacaoi, was investigated further to discover new antimicrobial metabolites via medium and temperature optimization using Box Behnken design. As a result, GPM medium containing 2.25% glycerol, 1% peptone water, 0.2% CaCO3, 0.1% MgCl2 in distilled water was found to provide the highest chemical diversity with potent bioactivity at 30oC. In subsequent studies, inductive effects of some microorganisms and inorganic compounds on secondary metabolism were also determined. Using optimized conditions, a larger fermentation study was undertaken (25 L) followed by extraction and isolation procedures. Sixteen metabolites were purified by chromatographic methods, and structures of the isolates were elucidated by spectral methods. Thirteen compounds, five of which were new, were members of polyketide-type polyether antibiotics. The structures of other molecules were determined as cyclo(Thr-Trp), 6-hydroxy-6-methyloctanoic acid, and 5-hydroxy-1,6-diazacycloundec-5-en-2-one, and all were found to be new. In antimicrobial tests, most polyethers were found to be active against Gram-positive bacteria. In particular, two new polyethers SC-EG-05 and SC-EG-07 showed higher antimicrobial activity than widely used antibiotic vancomycinen_US
dc.description.abstractİkincil metabolitler birçok farklı organizma tarafından üretilen düşük molekül ağırlıklı doğal ürünlerdir. Bu moleküller doğada gösterdikleri adaptif rolleri nedeniyle çeşitli biyoaktivitelere sahiptirler. Bu özellikleriyle ikincil metabolitler ilaç keşfi çalışmalarında çok önemli bir kaynak durumundadırlar. Streptomyces türü bakteriler ise enfeksiyonlar ve kanser başta olmak üzere çeşitli hastalıkların tedavisi için umut vaat eden biyoaktif metabolitlerin üreticisi olarak ilgi çekmektedirler. Ancak ikincil metabolizma, standart laboratuvar şartlarında tümüyle ifade edilmemektedir. Bu durum mikrobiyal kaynaklardan yeni/özgün biyoaktif moleküllerin keşfini kısıtlamaktadır. Bu çalışmada, daha önce çalışılmış bir denizel türevli aktinobakteri olan Streptomyces cacaoi'den, Box-Behnken tasarım ile besiyeri ve sıcaklık optimizasyonu yapılarak yeni antimikrobiyal metabolitlerin elde edilmesi amaçlanmıştır. Sonuç olarak, distile suda %2.25 gliserol, %1 peptone-water, %0.2 CaCO3, %0.1 MgCl2 içeren GPM besiyerinin 30oC sıcaklıkta en fazla kimyasal çeşitliliği ve en yüksek biyoaktiviteyi sağladığı görülmüştür. İleri çalışmalarda ise bazı mikroorganizmaların ve inorganik bileşiklerin ikincil metabolizma üzerine indükleyici etkileri tespit edilmiştir. Optimize koşullar kullanılarak büyük ölçekte fermentasyon (25 L) gerçekleştirilmiş, ekstraksiyon ve izolasyon çalışmaları yapılmıştır. Kromatografik yöntemlerle 16 metabolit saflaştırılmış ve spektral yöntemlerle yapıları aydınlatılmıştır. Metabolitlerin 13'ünün poliketit tipi polieter antibiyotik oldukları ve bunların beş tanesinin literatür için yeni oldukları anlaşılmıştır. Diğer üç molekülün yapılarının ise siklo(Thr-Trp), 6-hidroksi-6-metiloktanoik asit ve 5-hidroksi-1,6-diazasikloundek-5-en-2-on olduğu belirlenmiş ve tümünün yeni olduğu anlaşılmıştır. Yapılan antimikrobiyal testlerde polieterlerin Gram-pozitif bakterilere karşı aktif oldukları tespit edilmiştir. Özellikle, yeni oldukları anlaşılan SC-EG-05 ve SC-EG-07 kodlu polieterler, antibiyotik olarak sıklıkla kullanılan vankomisinden daha yüksek antimikrobiyal aktivite göstermiştir.en_US
dc.format.extentxvi, 146 leaves-
dc.language.isoenen_US
dc.publisherIzmir Institute of Technologyen_US
dc.relationBazı Deniz Kaynaklı Streptomyces Türlerinin İkincil Metabolizmasının İndüklenmesi, ve Biyoaktif İkincil Metabolitlerin İzolasyonu ve Tanımlanmasıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectSecondary metaboliteen_US
dc.subjectActinobacteriaen_US
dc.subjectMetabolitesen_US
dc.subjectStreptomyces cacaoien_US
dc.titleInduction of secondary metabolism of some marine derived Streptomyces species, and isolation and identification of their bioactive secondary metabolitesen_US
dc.title.alternativeBazı deniz kaynaklı Streptomyces türlerinin ikincil metabolizmasının indüklenmesi, ve biyoaktif ikincil metabolitlerinin izolasyonu ve tanımlanmasıen_US
dc.typeMaster Thesisen_US
dc.departmentThesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Bioengineeringen_US
dc.contributor.affiliation01. Izmir Institute of Technologyen_US
dc.relation.grantno2019IYTE0273en_US
item.grantfulltextopen-
item.openairecristypehttp://purl.org/coar/resource_type/c_18cf-
item.fulltextWith Fulltext-
item.languageiso639-1en-
item.openairetypeMaster Thesis-
item.cerifentitytypePublications-
crisitem.author.dept01. Izmir Institute of Technology-
Appears in Collections:Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri
Files in This Item:
File Description SizeFormat 
654632.pdfMasterThesis14.35 MBAdobe PDFView/Open
Show simple item record



CORE Recommender

Page view(s)

500
checked on May 27, 2024

Download(s)

452
checked on May 27, 2024

Google ScholarTM

Check





Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.