Please use this identifier to cite or link to this item: https://hdl.handle.net/11147/11749
Full metadata record
DC FieldValueLanguage
dc.contributor.authorYılmaz, Sevdan-
dc.contributor.authorKüçüker, Mehmet Ali-
dc.contributor.authorKahraman, Dilek-
dc.date.accessioned2021-12-02T18:14:01Z-
dc.date.available2021-12-02T18:14:01Z-
dc.date.issued2021-
dc.identifier.issn2548-0006-
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.35229/jaes.966509-
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11147/11749-
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/yayin/detay/450548-
dc.description.abstractThe present study investigates the planktonic communities through metagenomics sequencing during a mucilage event in the Çanakkale Strait (Dardanelles), Turkey. Mucilage samples were collected in May 2021 during an intense period of mucilage formation in three different stations of Dardanelles (Station 1: 40°9'8.09"N, 26°24'16.19"E; Station 2: 40°6'21.62"N, 26°22'41.25"E; Station 3: 40°6'42.78"N, 26°23'57.00"E). The dominant planktonic eukaryotes, at the phylum level, were Dinoflagellata (38.57%), Protalveolata (15.03%), Diatomea (12.41%), Nematozoa (8.44%), Apicomplexa (6.79%) and Chlorophyta (5.43%), which constituted 86.68 % of the total number of sequences. The most dominant OTUs (>10%), were Alexandrium and Syndiniales Group II. other dominant OTUs (>2%) were Viscosia sp., Lankesteria, Arcocellulus, Thalassiosira and Nannochloris. This study has clarified the situation of planktonic communities during a mucilage event in the Çanakkale Strait (Dardanelles), Turkey. As a result, the most dominant genus was Alexandrium, which has been known to produce mucilage. Some Alexandrium species can produce toxins, cause severe impacts on human health, and lead to bivalve, shrimp, and fish mortality. Therefore, a more detailed study is needed to determine the Alexandrium toxins in the mucilage structure. In addition, the heavy metal content of the obtained mucilage was investigated, and the concentrations of the As and Cr are above the disposal limits in the landfill sites. Therefore, collected mucilage from the sea surface should be checked before sending it to landfill sites in terms of the heavy metal content.en_US
dc.description.abstractBu çalışmada Çanakkale Boğazı'ında (Dardanel) müsilaj oluşumu sırasında planktonik toplulukların kompozisyonları metagenomik yaklaşımla araştırılmıştır. Müsilaj örnekleri, Çanakkale Boğazı'nın üç farklı istasyonunda (İstasyon 1: 40°9'8.09"K, 26°24'16.19"D; İstasyon 2: 40°6'21.62"K, 26°22'41.25"D; İstasyon 3: 40°6'42.78"K, 26°23'57.00"D) yoğun müsilaj oluşumu gözlemlenen Mayıs 2021'de toplanmıştır. Filum düzeyinde toplam sekans sayısının 86.68% ini kapsayan baskın planktonik ökaryotlar, Dinoflagellata (%38,57), Protalveolata (%15,03), Diatomea (%12,41), Nematozoa (%8,44), Apicomplexa (%6,79) ve Chlorophyta (%5,43) olarak belirlenmiştir. En baskın OTU'ler (>%10), Alexandrium ve Syndiniales Group II olup, diğer baskın OTU'lar (>%2) ise Viscosia sp., Lankesteria, Arcocellulus, Thalassiosira ve Nannochloris olmuştur. Bu çalışma, Türkiye'de meydana gelen bir müsilaj olayı sırasında Çanakkale Boğazı'nda planktonik toplulukların durumunu netleştirmiştir. Sonuç olarak, en baskın cinsin müsilaj üretme kabiliyeti olduğu bilinen Alexandrium olduğu belirlenmiştir. Bazı Alexandrium türleri toksin üretebilir, insan sağlığı üzerinde ciddi etkilere neden olabilir ve çift kabuklu, karides ve balık ölümlerine yol açabilir. Bu nedenle müsilaj yapısındaki Alexandrium toksinlerinin belirlenmesi için daha detaylı bir çalışmaya ihtiyaç vardır. Ayrıca elde edilen müsilajın ağır metal içeriği araştırılmıştır. Müsilajın yapısındaki As ve Cr konsantrasyonları atıklar için belirlenen düzenli depolama sahalarına bertaraf etme sınırlarının üzerindedir. Bu nedenle deniz yüzeyinden toplanan müsilajın düzenli depolama sahalarına gönderilmeden önce ağır metal içeriği kontrol edilmelidir.en_US
dc.language.isoenen_US
dc.relation.ispartofJournal of Anatolian Environmental and Animal Sciences (JAES)en_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectÇanakkale Strait (dardanelles)en_US
dc.subjectEukaryotic biodiversityen_US
dc.subjectHeavy metalen_US
dc.subjectMetagenomic sequencingen_US
dc.titleMetagenomic characterization of planktonic communities during a mucilage event in the Çanakkale Strait (Dardanelles), Turkeyen_US
dc.title.alternativeÇanakkale Boğazı'nda (Dardanel) Müsilaj Oluşumu Sırasında Planktonik Toplulukların Metagenomik Karakterizasyonu, Türkiyeen_US
dc.typeArticleen_US
dc.institutionauthorKüçüker, Mehmet Ali-
dc.departmentİzmir Institute of Technology. Environmental Engineeringen_US
dc.identifier.volume6en_US
dc.identifier.issue3en_US
dc.identifier.startpage421en_US
dc.identifier.endpage427en_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.identifier.doi10.35229/jaes.966509-
local.message.claim2023-01-26T15:52:55.277+0300|||rp04196|||submit_approve|||dc_contributor_author|||None*
dc.identifier.trdizinid450548en_US
item.openairetypeArticle-
item.openairecristypehttp://purl.org/coar/resource_type/c_18cf-
item.fulltextWith Fulltext-
item.languageiso639-1en-
item.cerifentitytypePublications-
item.grantfulltextopen-
crisitem.author.dept03.07. Department of Environmental Engineering-
Appears in Collections:Environmental Engineering / Çevre Mühendisliği
TR Dizin İndeksli Yayınlar / TR Dizin Indexed Publications Collection
Files in This Item:
File SizeFormat 
402512f1-be93-4ce2-8bb7-17fc8c8739e6.pdf1.18 MBAdobe PDFView/Open
Show simple item record



CORE Recommender

Page view(s)

1,746
checked on Mar 25, 2024

Download(s)

88
checked on Mar 25, 2024

Google ScholarTM

Check




Altmetric


Items in GCRIS Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.